Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rnf139Q7TMV1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms