Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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