Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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