Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cspg5Q71M36 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cspg5Q71M36 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cspg5Q71M36 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cspg5Q71M36 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cspg5Q71M36 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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