Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms