Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmeff1Q6PFE7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms