Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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