Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms