Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms