Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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