Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q6DFW0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms