Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pram1Q6BCL1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pram1Q6BCL1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pram1Q6BCL1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pram1Q6BCL1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pram1Q6BCL1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pram1Q6BCL1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pram1Q6BCL1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms