Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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PtprdQ64487 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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PtprdQ64487 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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