Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a5Q63ZW6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms