Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ss18Q62280 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ss18Q62280 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ss18Q62280 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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