Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms