Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm5dQ62240 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms