Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rbm38Q62176 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rbm38Q62176 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rbm38Q62176 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rbm38Q62176 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rbm38Q62176 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rbm38Q62176 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rbm38Q62176 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rbm38Q62176 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rbm38Q62176 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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