Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tfap2bQ61313 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms