Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms