Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln3Q61124 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms