Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms