Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3Q60803 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3Q60803 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Traf3Q60803 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf3Q60803 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Traf3Q60803 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf3Q60803 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf3Q60803 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf3Q60803 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf3Q60803 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Traf3Q60803 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3Q60803 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf3Q60803 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3Q60803 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf3Q60803 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf3Q60803 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf3Q60803 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3Q60803 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf3Q60803 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3Q60803 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3Q60803 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3Q60803 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3Q60803 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3Q60803 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3Q60803 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3Q60803 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf3Q60803 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms