Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms