Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a1Q60714 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms