Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Foxd4Q60688 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Foxd4Q60688 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Foxd4Q60688 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Foxd4Q60688 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Foxd4Q60688 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Foxd4Q60688 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Foxd4Q60688 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Foxd4Q60688 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Foxd4Q60688 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Foxd4Q60688 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd4Q60688 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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