Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms