Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc5a6Q5U4D8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc5a6Q5U4D8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms