Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trim38Q5SZ99 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trim38Q5SZ99 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms