Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Med13Q5SWW4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Med13Q5SWW4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms