Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsr1Q5SWD9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tsr1Q5SWD9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tsr1Q5SWD9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tsr1Q5SWD9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tsr1Q5SWD9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tsr1Q5SWD9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tsr1Q5SWD9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tsr1Q5SWD9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tsr1Q5SWD9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms