Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms