Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms