Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms