Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11487Q5RIS0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms