Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms