Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms