Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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