Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms