Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms