Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms