Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trim80Q3V061 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trim80Q3V061 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trim80Q3V061 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trim80Q3V061 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trim80Q3V061 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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