Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ttc9Q3V038 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ttc9Q3V038 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ttc9Q3V038 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ttc9Q3V038 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Ttc9Q3V038 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc9Q3V038 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ttc9Q3V038 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms