Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms