Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrfip1Q3UZ39 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrfip1Q3UZ39 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrfip1Q3UZ39 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrfip1Q3UZ39 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrfip1Q3UZ39 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrfip1Q3UZ39 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrfip1Q3UZ39 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrfip1Q3UZ39 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrfip1Q3UZ39 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrfip1Q3UZ39 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrfip1Q3UZ39 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrfip1Q3UZ39 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrfip1Q3UZ39 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrfip1Q3UZ39 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrfip1Q3UZ39 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms