Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd3l2Q3UXB0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd3l2Q3UXB0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms