Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms