Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmem253Q3UNB8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tmem253Q3UNB8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms