Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b2Q3UJB0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b2Q3UJB0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms