Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms